Oddělení se zabývá hydraulickým výzkumem vodních toků i objektů na tocích, sledováním a modelováním transportu polutantů plaveninami a resuspendovanými sedimenty.
obor zabývající se podzemními vodami, jejich původem, podmínkami výskytu, zákony pohybu, jejich fyzikálními a chemickými vlastnostmi a jejich interakcí s okolním prostředím.